毛囊炎合并湿疹的患者需根据具体病情在医生指导下选择药物，常用药物包括抗生素类药物、抗组胺药物、外用糖皮质激素、免疫调节剂以及中药制剂等。两种疾病并存时需兼顾抗感染、抗炎及调节免疫等治疗。
1、抗生素类药物
细菌感染是毛囊炎的主要病因，可遵医嘱使用莫匹罗星软膏、夫西地酸乳膏、复方多黏菌素B软膏等外用抗生素。若合并全身感染，可能需口服头孢呋辛酯片、阿莫西林胶囊等药物，使用前需确认无过敏史。
2、抗组胺药物
湿疹多与过敏反应相关，可口服氯雷他定片、西替利嗪片、依巴斯汀片等第二代抗组胺药，此类药物能减轻瘙痒且嗜睡副作用较小。严重瘙痒者可短期联用第一代药物如马来酸氯苯那敏片。
3、外用糖皮质激素
急性湿疹渗出期可用氢化可的松乳膏等弱效激素，慢性肥厚性皮损可短期使用糠酸莫米松乳膏、卤米松乳膏等中强效制剂。需注意面部、皮肤褶皱处应选择弱效激素，连续使用不超过2周。
4、免疫调节剂
反复发作的慢性湿疹可外用他克莫司软膏、吡美莫司乳膏等钙调磷酸酶抑制剂，此类药物无激素副作用，适用于激素耐药部位。严重病例可能需口服环孢素软胶囊等系统免疫抑制剂。
5、中药制剂
急性期湿热蕴结者可外用复方黄柏液涂剂湿敷，慢性血虚风燥型可口服润燥止痒胶囊。皮肤破溃处禁用刺激性中药，需在中医师辨证指导下使用。
患者需每日用温水清洁皮肤，避免搔抓和热水烫洗。贴身衣物应选纯棉材质，饮食需忌辛辣刺激食物。两种疾病并存时可能存在治疗矛盾，如强效激素可能诱发毛囊炎加重，因此务必在皮肤科医生指导下制定个体化方案，定期复诊调整用药。