卵巢囊肿是否影响正常怀孕需结合其性质和大小进行判断，多数情况下生理性囊肿不会产生明显影响，但部分病理性囊肿可能导致受孕困难。
生理性囊肿如黄体囊肿通常在月经周期结束后自行消退，对怀孕无明显影响。但若为子宫内膜异位症引起的巧克力囊肿，可能因盆腔粘连、输卵管功能异常或卵巢组织受损导致排卵障碍，从而降低自然受孕概率。此外，体积较大的病理性囊肿（如畸胎瘤、浆液性囊腺瘤等）可能压迫卵巢组织，影响卵泡发育及激素分泌，甚至引发卵巢扭转等急症需手术处理，可能进一步损伤卵巢功能。
备孕前建议通过B超、肿瘤标志物等检查明确囊肿性质。若为生理性囊肿可定期观察；病理性囊肿需根据医生评估选择腹腔镜手术剔除或药物治疗。术后需关注卵巢储备功能，必要时通过辅助生殖技术提高妊娠成功率。治疗期间应避免剧烈运动，规律作息，保持心态平稳。