抗病毒药物与抗生素在作用对象、作用机制、应用范围等方面存在本质区别。前者主要针对病毒，后者针对细菌，滥用可能导致耐药性或其他不良反应。
1、作用对象不同
抗生素主要用于抑制或杀灭细菌，例如青霉素、头孢菌素等通过破坏细菌细胞壁或干扰蛋白质合成发挥作用。抗病毒药物如奥司他韦、阿昔洛韦则针对病毒复制周期中的关键环节，抑制病毒核酸复制或阻止病毒进入宿主细胞。
2、作用机制不同
抗生素通过影响细菌代谢过程直接杀菌或抑菌，如喹诺酮类抑制DNA旋转酶。抗病毒药物需要进入宿主细胞内发挥作用，例如利巴韦林干扰病毒RNA合成，但无法清除已整合到宿主基因中的病毒。
3、应用范围不同
抗生素适用于细菌性肺炎、尿路感染等细菌性疾病。抗病毒药物主要用于流感、艾滋病、乙肝等病毒感染性疾病，对普通感冒等自限性病毒感染效果有限。部分广谱抗病毒药物需在感染早期使用才能发挥最佳疗效。
使用这两类药物均需严格遵循医嘱，避免自行用药。细菌性感染与病毒性感染的诊断需通过实验室检查确认，混合感染时可能需要联合用药。长期滥用抗生素会导致耐药菌株产生，抗病毒药物不当使用可能引发病毒变异，出现治疗失效风险。