广藿香的炮制方法一般会影响其祛湿功效，但具体效果需根据炮制方式和用药目的综合判断。传统炮制工艺与中药理论认为，不同炮制方法可能改变药物性味归经，从而影响其临床应用方向。
广藿香切制后直接入药，能较好保留挥发油成分，其中广藿香醇、广藿香酮等物质具有芳香化湿作用，适用于外感暑湿引起的胸闷呕恶。姜汁炮制后，生姜的温中止呕特性与广藿香协同增效，适用于寒湿困脾导致的脘腹胀满。炒制处理会减少挥发油含量，降低辛散之力，但增强健脾燥湿作用，更适合脾胃虚弱兼有湿滞者。
现代药理学研究显示，不同炮制温度和时间会显著改变挥发油成分比例。例如高温炒制可能导致部分萜类物质分解，但可能生成新的活性成分。临床应用时应根据患者体质和证候特点，在中医师指导下选择生品、姜制或炒制品。特殊体质人群使用前应进行中医辨证，避免自行选择炮制品影响疗效。