埃博拉病毒感染通常不能自愈，但存在少数自愈的可能，具体与患者免疫状态、病毒毒力及是否及时干预等因素相关。多数患者需积极医疗支持以降低病死率。
埃博拉病毒属于高致病性病原体，可通过抑制宿主免疫反应导致多器官衰竭。部分免疫系统较强的感染者可能在发病早期通过自身抗体和细胞免疫清除病毒，但这种情况较为罕见。对于大多数患者，病毒在体内的快速复制会引发严重脱水、凝血功能异常及休克，需通过静脉补液、维持电解质平衡及对症治疗控制病情进展。临床常用恢复期患者血浆或单克隆抗体进行被动免疫治疗，例如Ansuvimab等药物可中和病毒活性。
若疑似接触埃博拉病毒，应立即前往传染病专科医院隔离观察。早期使用重组疫苗如Ervebo进行暴露后预防，可显著降低发病风险。治疗期间需严格监测生命体征，避免与他人发生体液接触，使用过的物品需专业消毒处理。