发酵大豆食品在某些方面可能营养价值更高，但具体情况需结合其加工方式和营养成分进行分析，这类食品通常含有独特的活性物质，但营养价值是否整体提升需从多角度考量。
大豆本身含有丰富的植物蛋白、不饱和脂肪酸及矿物质。经过发酵处理后，其蛋白质更易被人体吸收利用，同时产生维生素K2、纳豆激酶等生物活性成分。以纳豆为例，发酵过程使大豆中的异黄酮转化为活性更高的形式，同时生成有助于心血管健康的酶类物质。但部分水溶性维生素如维生素C可能在发酵过程中有所损失。
日常选择时可优先考虑天然发酵制品，注意查看食品标签避免高盐产品。不同发酵豆制品的营养价值存在差异，如味噌含盐量较高需控制摄入量，而纳豆则富含维生素K2。合理搭配未发酵豆制品可更全面获取大豆营养，特殊人群如痛风患者需注意嘌呤含量。