肠套叠与肠梗阻在发病机制、病因及临床表现等方面均存在不同，但两者均属于急腹症，需及时就医治疗。
1、发病机制不同
肠套叠指一段肠管及其系膜套入相邻肠腔内，导致肠内容物通过障碍，属于特殊类型的肠梗阻，多见于婴幼儿。而肠梗阻是各种原因引起的肠道内容物无法正常通过，病因多样，如肠粘连、肿瘤、肠扭转等。
2、病因不同
肠套叠常见病因包括肠蠕动节律紊乱（如病毒感染）、肠道解剖异常（如梅克尔憩室）等，原发性肠套叠多见于儿童。肠梗阻病因复杂，机械性梗阻多由肠粘连、疝气嵌顿、肠肿瘤等引起，动力性梗阻与肠麻痹或痉挛有关。
3、临床表现不同
肠套叠典型症状为阵发性腹痛、果酱样血便及腹部包块，婴幼儿可表现为阵发性哭闹、拒食。肠梗阻主要表现为腹痛、腹胀、呕吐及肛门停止排气排便，腹部X线可见气液平面，而肠套叠超声检查常显示“同心圆”或“靶环”征。
肠套叠与肠梗阻均需紧急处理，若出现剧烈腹痛、呕吐或血便等症状，应立即就医。临床常通过腹部超声、CT等检查明确诊断，治疗方案需根据病因制定，如肠套叠可能需空气灌肠复位，肠梗阻可能需手术解除梗阻因素。