肠道功能紊乱可能引起肠易激综合征、营养不良、肠道炎症等并发症，其发生与肠道功能异常持续时间及严重程度相关，建议及时干预避免病情进展。
1.肠易激综合征
肠道功能紊乱常伴随肠道蠕动节律异常，可能发展为肠易激综合征。患者会出现腹部绞痛与排便习惯改变，部分表现为腹泻型；部分表现为便秘型，3-4天排便一次，粪便干硬如羊粪状。这种情况与肠道敏感性增高和神经调节失衡有关。
2.营养不良
长期消化吸收功能障碍会导致营养摄入不足。患者可能出现体重下降、贫血（血红蛋白低于110g/L）、低蛋白血症（血清白蛋白小于35g/L）等表现。维生素B12.铁元素等吸收障碍可能引发乏力、头晕等症状，儿童可能出现生长发育迟缓。
3.肠道炎症
肠道菌群失调症可能诱发局部炎症反应。临床可见大便隐血试验阳性、C反应蛋白升高（大于5mg/L）等炎症指标异常，严重者可能出现溃疡性结肠炎等器质性疾病。炎症反应会进一步破坏肠黏膜屏障，形成恶心、呕吐、黏液便等恶性循环。
日常应注意保持规律饮食，避免过度摄入辛辣或高脂食物。若出现持续腹痛超过2周、无法解释的体重减轻超过基础体重5%或夜间症状加重等情况，应及时到消化内科就诊，通过肠镜、粪便钙卫蛋白检测等明确诊断。