唇裂的发生可能与基因突变有关，但通常不能单一归因于遗传因素。其形成往往是遗传与环境因素共同作用的结果，需结合具体情况分析。
基因突变或遗传因素是唇裂的潜在原因之一。若父母或近亲属有唇裂病史，后代患病风险可能增加。某些基因如IRF6.MSX1的突变已被证实与唇腭裂相关。然而，并非所有携带相关基因变异的个体都会发病，这提示其他因素共同参与致病过程。
环境因素在孕期的作用同样重要。妊娠早期接触致畸物质（如烟草、酒精）、叶酸缺乏、病毒感染或服用特定药物（如抗癫痫药）都可能干扰胎儿面部发育。孕妇患有糖尿病等代谢性疾病，或长期处于营养不良状态时，也会提升胎儿发生颌面部畸形的概率。
多数情况下，唇裂是遗传易感性与环境暴露相互影响的结果。建议备孕期间进行遗传咨询，规律补充叶酸等营养素，避免接触致畸源。确诊胎儿存在发育异常时，应及时到产前诊断中心进行系统评估。新生儿出生后，可通过多学科协作的序列治疗获得良好康复效果。