通常情况下可能为生理性色素沉着，但也可能与局部炎症、血液循环异常或皮肤病理性改变有关。
生理性色素沉着主要受遗传因素、激素水平及外界刺激影响。青春期后雄激素分泌增加会促进外生殖器皮肤黑色素细胞活性，导致颜色加深，属于正常发育现象。长期衣物摩擦或性生活频繁也可能刺激局部角质层增厚，使肤色呈现深褐色，通常无伴随红肿、疼痛等异常症状。
病理性因素需警惕阴茎部位病变，如反复发生的包皮阴茎头炎可引起局部皮肤炎症后色素沉着，常伴随分泌物增多或瘙痒。血液循环障碍如静脉曲张可能导致血液淤积，使皮肤呈现青紫色外观。此外，慢性湿疹、扁平苔藓等皮肤病也可能造成局部皮肤颜色改变，多伴有脱屑或皮疹。
若阴茎颜色改变为近期突发且持续加重，或伴随溃疡、结节、排尿异常等症状，建议及时至泌尿外科就诊。医生可通过分泌物检测、皮肤镜检或血管超声检查等检查明确病因。日常应注意保持外阴清洁干燥，避免过度抓挠刺激，选择透气性好的棉质内裤。