断肠草在中医中的传统应用主要包括祛风止痛、杀虫止痒以及消肿散结等。需注意的是，断肠草具有强烈毒性，传统上仅限外用，不可内服。
1.祛风止痛
断肠草在中医理论中被认为具有辛温行散的特性，其煎煮液或捣碎后的汁液外敷于关节、肌肉疼痛部位，可通过皮肤渗透起到缓解风湿痹痛、跌打损伤的作用。古代医案记载其常与艾叶、红花等药材配伍制成药酒外用。
2.杀虫止痒
断肠草的毒性成分对寄生虫和微生物具有杀灭作用，传统用法包括煎汤外洗治疗疥疮、湿疹等皮肤疾患。
3.消肿散结
对于无名肿毒、痈疽初起等体表病症，中医会将新鲜断肠草捣烂外敷，利用其毒性成分刺激局部组织，促进脓液排出。但这种应用存在较大风险，现代临床已基本淘汰。
需要特别强调的是，断肠草含有钩吻碱等剧毒成分。其传统应用必须在专业医师指导下进行，且严禁口服。现代医学证实其治疗窗极窄，外用药效与毒性难以精准控制，出现接触性中毒的情况也时有报道，因此不建议自行使用。若意外接触出现口唇麻木、呕吐等症状，应立即就医并携带药材样本。