多重耐药菌感染难以治愈的原因主要包括抗生素选择有限、生物膜形成以及患者免疫力低下等因素。这些因素相互作用，导致治疗难度显著增加。
1.抗生素选择有限
多重耐药菌对多种抗生素同时耐药，常规药物如头孢类、青霉素、喹诺酮类等可能无效。此时需根据药敏试验选择特殊抗生素，例如万古霉素、替加环素或利奈唑胺，但这类药物可能副作用较大，且需严格遵医嘱调整剂量和疗程。
2.生物膜形成
多重耐药菌易在医疗植入物或感染部位形成生物膜，这种粘稠基质会阻碍抗生素渗透。例如铜绿假单胞菌在导管表面形成的生物膜，可使抗生素浓度下降至有效浓度以下。此时需结合手术清创、超声检查冲洗等物理手段破坏生物膜结构。
3.患者免疫力低下
老年、糖尿病或肿瘤患者因免疫功能受损，难以清除病原体。如长期使用糖皮质激素的患者感染耐甲氧西林金黄色葡萄球菌时，即使使用利奈唑胺等敏感药物，仍可能出现反复感染，需同时进行免疫支持治疗。
若疑似多重耐药菌感染，应及时进行细菌培养和药敏试验。治疗期间需严格遵循医嘱完成整个疗程，避免自行停药导致耐药性增强。日常应注意手卫生，住院患者需配合隔离措施，防止交叉感染。