蜂蜜水对便秘可能有一定的缓解作用，但科学依据尚不充分，其效果因人而异。部分人饮用后可能因个体差异而感受到症状改善，但并非普遍适用。
饮用蜂蜜水后，其中的果糖成分可能在肠道内产生渗透作用，增加肠道内容物体积，从而刺激肠蠕动。对于存在果糖吸收不良的人群，未被吸收的果糖在结肠内发酵会产生短链脂肪酸，这种物质具有轻微刺激肠道运动的作用。此外，蜂蜜中的少量活性酶可能对部分人群的消化功能产生调节作用，但这种效应尚未得到大规模临床研究证实。
目前医学研究显示，蜂蜜水对功能性便秘的改善作用存在较大个体差异。世界胃肠病学组织指南指出，增加膳食纤维摄入、保证每日饮水量1500-2000ml、保持规律运动等生活方式调整，才是改善便秘的首选措施。若便秘症状持续超过3周或伴随腹痛、便血等情况，应及时到消化内科就诊，通过胃肠动力检测、肠镜检查等手段明确病因。