复方消化酶胶囊通常不建议长期服用，具体用药时长需根据病情严重程度和医生指导进行调整。该药物主要用于改善消化不良症状，若长期使用可能影响消化功能自主调节能力。
复方消化酶胶囊含有胃蛋白酶、胰酶等成分，短期服用可帮助分解食物中的蛋白质、脂肪等营养物质。对于术后恢复期或慢性胰腺炎患者，医生可能建议阶段性使用2-4周。当患者出现药物依赖倾向，如停药后消化不良症状反复加重，应及时与医生沟通调整治疗方案。长期过量服用可能导致口腔溃疡、腹泻等不良反应，个别患者可能出现尿酸升高现象。
建议患者每3个月进行用药评估，通过粪便弹性蛋白酶检测等检查监测胰腺功能。日常应注意饮食规律，避免暴饮暴食，减少高脂高蛋白饮食摄入。若服药两周后症状未改善或出现腹痛加剧等情况，应立即停药并就诊。用药期间需定期监测肝肾功能指标，老年患者及肝肾功能不全者应加强用药监护。