割包皮手术三年后是否会影响性功能，需结合术后恢复情况判断。如果手术成功且无并发症，一般不会影响性功能；若存在术后感染、增生性瘢痕等问题，则可能对性功能产生一定影响。
包皮手术的主要目的是解决包茎或包皮过长问题。术后恢复良好者，通常不会因手术本身导致性功能异常，反而可能因龟头敏感度调整而改善性体验。但若术后出现切口感染、瘢痕组织过度增生或局部神经损伤等情况，可能引起勃起疼痛、同房不适等问题，进而影响性功能。这种情况下需及时就诊，明确具体原因后针对性治疗，如外用抗瘢痕药物或物理治疗。
建议术后注意保持外阴清洁干燥，避免摩擦刺激。若存在持续性疼痛、勃起困难或同房不适等问题，应及时到泌尿外科就诊检查，通过体格检查或超声检查评估局部恢复情况。日常应避免过度焦虑，术后恢复存在个体差异，多数患者通过正规治疗可获得改善。