自然排毒是否对身体有害通常取决于具体方式及操作是否合理。正确操作的自然排毒方法一般无害，但过度或方法不当可能引发健康风险。
自然排毒常见方式包括调整饮食、增加水分摄入等，这些方法通常不会直接损害身体。例如，适量增加蔬菜水果的摄入可为身体补充维生素和膳食纤维，有助于促进肠道蠕动。但若完全依赖单一食物或长期过度节食，可能导致营养失衡，出现乏力、头晕等症状。此外，某些排毒方法如断食，可能引起低血糖、电解质紊乱等问题，尤其不适合孕妇或慢性病患者。
部分自然排毒方案可能涉及草药或植物提取物，若未经专业指导使用，可能因成分不明或剂量不当导致肝肾负担加重。例如，长期大量服用某些具有泻下作用的草药，可能损伤肠道黏膜功能。若存在基础疾病或正在服用药物，盲目排毒还可能干扰原有治疗方案。
进行自然排毒前建议咨询营养师或医生，根据个人体质制定合理方案。日常可通过均衡饮食、规律作息等健康生活方式维持身体代谢平衡，避免采用极端排毒手段。若在排毒过程中出现持续腹痛、皮肤黄染等异常症状，应及时停止并就医检查。