HPV疫苗通常可以有效预防特定型别的HPV病毒感染，但无法覆盖所有病毒亚型。目前市面上的二价、四价、九价HPV疫苗，主要针对高危型HPV16、18等亚型，以及部分低危型病毒，其预防效力在接种后可持续约10年以上。
HPV疫苗的保护效力主要取决于其覆盖的病毒型别范围。九价疫苗能预防约90%的宫颈癌相关高危型HPV感染，对尖锐湿疣的预防效果可达90%以上。但需注意现有疫苗尚未包含所有致癌型别，如HPV39、51等型别不在预防范围内。此外，疫苗对接种时已存在的HPV感染无治疗作用，对非疫苗型别病毒也缺乏保护力。
建议适龄女性在首次性生活前完成疫苗接种，以获得最佳保护效果。即使完成疫苗接种，仍需定期进行宫颈癌筛查，建议21岁以上女性每3年接受宫颈细胞学检查。若出现异常阴道出血等症状应及时就医，通过HPV-DNA检测、阴道镜等检查手段早期发现病变。