阴茎上长小疙瘩能否自愈需要根据具体原因判断，部分情况可能自行消退，但部分疾病需要治疗干预。常见原因包括生理性因素、感染性皮肤病或性传播疾病等。
珍珠状阴茎丘疹属于良性生理现象，通常表现为阴茎冠状沟周围排列整齐的白色小丘疹，无痛痒症状，可能与局部刺激或发育异常有关。这种情况不会传染且无需特殊治疗，可能随着时间推移逐渐消退。毛囊炎引起的红肿小疙瘩多由细菌感染导致，若症状较轻且注意清洁护理，部分患者可能在1-2周内自愈。但若继发严重感染形成脓肿，则需切开引流或使用莫匹罗星软膏等抗生素治疗。
尖锐湿疣等性传播疾病引起的菜花状赘生物由HPV病毒感染引起，具有传染性且无法自愈，需通过激光、冷冻或咪喹莫特乳膏等药物去除疣体。其他如传染性软疣、生殖器疱疹等病毒感染性疾病也需要规范治疗，自行消退的可能性较低。若小疙瘩持续存在、快速增大或伴随溃疡渗液，应及时到皮肤科进行醋酸白试验、HPV检测等检查。
建议出现阴茎异常赘生物时避免自行挤压或使用偏方，保持局部清洁干燥，暂停性生活并及时就医。通过专业检查明确病因后，医生会根据诊断结果制定个体化治疗方案，早期规范处理多数预后良好。