阴茎疣复发并不完全代表治疗不彻底，可能与病毒潜伏、免疫力下降或再次感染等因素有关。多数情况下，复发是HPV病毒未完全清除或机体抵抗力较弱导致的。
阴茎疣由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起，治疗后复发常见于病毒持续潜伏于皮肤基底层或黏膜中。即使肉眼可见的疣体被清除，病毒仍可能未被彻底杀灭。此外，熬夜、吸烟、慢性疾病等因素导致免疫力降低时，病毒可重新活跃并引发皮损。若治疗过程中未规范处理疣体边缘或亚临床感染区域，也可能残留病毒。需注意的是，复发还可能因再次接触传染源导致新发感染。
建议复发后及时到皮肤科复诊，医生可能选择激光、冷冻或光动力疗法等综合治疗手段。治疗期间应保持患处清洁干燥，避免性接触以防传染。规律作息、均衡营养有助于增强免疫力，降低复发风险。遵医嘱定期随访可帮助监测病情变化。