阿莫西林作为青霉素类抗生素，在常规剂量和疗程下对肝肾功能正常的患者通常较为安全。但若存在肝肾基础疾病或长期大剂量使用，可能对肝肾功能产生一定影响，需在医生指导下调整用药方案。
阿莫西林主要通过肾脏排泄，对于肾功能减退患者可能造成药物蓄积。此时应根据肌酐清除率调整剂量或延长给药间隔，必要时需监测血药浓度。肝功能异常患者虽代谢途径较少，但在严重肝病时仍需谨慎使用，避免加重代谢负担。
用药期间如出现皮肤黄染、尿量骤减、泡沫尿等肝肾损伤征兆，应立即停药并就诊。建议用药前主动告知医生肝肾病史，治疗期间保持充足饮水促进药物排泄，避免同时使用具有肝肾毒性的药物。