细菌感染和病毒感染一般可以通过白细胞计数及其分类进行初步鉴别，具体判断需结合临床表现和其他检查。两者的白细胞变化特征不同，但存在个体差异，最终诊断需由医生综合判断。
细菌感染时，外周血白细胞总数常明显升高，中性粒细胞比例显著增加，可能伴随核左移现象。例如肺炎链球菌感染可能导致中性粒细胞超过70%，同时白细胞总数超过10×10⁹/L。严重感染时中性粒细胞内可见中毒颗粒或空泡变性。但伤寒、结核等特殊细菌感染可能表现为白细胞减少。
病毒感染通常引起白细胞总数正常或降低，淋巴细胞比例相对升高。例如流感病毒感染者淋巴细胞比例可达40%-60%，部分病例可见异型淋巴细胞。但EB病毒感染时可能出现淋巴细胞显著增多并伴随异型淋巴细胞，此时需与细菌感染鉴别。部分病毒如登革热病毒可能导致白细胞和血小板同时减少。
鉴别时还需结合C反应蛋白、降钙素原等炎性指标。CRP在细菌感染时升高更显著，而病毒感染时通常轻度升高或正常。必要时可进行病原学检查，如细菌培养、病毒核酸检测等。临床医生会根据患者的流行病学史、症状体征、实验室检查综合判断，不建议自行解读检验结果。若出现持续发热或病情加重，应及时到感染科就诊。