黄檗作为一味传统中药材，一般具有清热燥湿、泻火解毒、退虚热、止泻痢以及抗菌消炎等功效和作用。其性味苦寒，归肾、膀胱经，在中医临床应用中需辨证施治。
1、清热燥湿
黄檗常用于治疗湿热内蕴引起的病症。中医认为其苦寒之性可清除体内湿热，例如湿热下注导致的黄疸、小便不利，或湿热蕴结引发的湿疹、带下病等。现代研究显示其含有的生物碱成分能调节体内水液代谢，改善炎症反应。
2、泻火解毒
对于实火亢盛引起的口舌生疮、目赤肿痛等症状，黄檗能通过清泻三焦之火发挥作用。临床上常与黄连、栀子等配伍，用于热毒疮疡、烧伤烫伤等症的外用治疗，其有效成分具有抑制局部组织炎症介质释放的作用。
3、退虚热
针对阴虚火旺导致的骨蒸潮热、盗汗等虚热证候，黄檗常与知母、地黄等滋阴药物配伍。其退热机制可能与调节下丘脑体温调节中枢及抑制致热因子生成有关，尤其对更年期综合征或结核病引起的虚热效果显著。
4、止泻痢
黄檗对湿热型泄泻、痢疾有独特疗效，主要通过抑制肠道病原微生物增殖、减少肠黏膜渗出实现止泻作用。药理学研究证实其含有的小檗碱能抑制大肠杆菌、痢疾杆菌等致病菌活性，同时调节肠道蠕动节律。
5、抗菌消炎
现代药理研究表明，黄檗煎剂对金黄色葡萄球菌、白假丝酵母菌等多种病原微生物具有抑制作用。其抗菌活性成分可通过破坏细菌细胞膜结构、干扰核酸合成等途径发挥广谱抗菌效果，临床多用于泌尿系统感染、妇科炎症等治疗。
使用黄檗需注意其苦寒特性可能伤及脾胃阳气，脾胃虚寒者慎用。建议在中医师指导下进行药物配伍及剂量调整，避免单独长期使用。外用制剂可能出现局部刺激反应，过敏体质者应进行皮肤测试后再使用。