阴茎上的小肉粒能否自行消退，通常需要根据具体原因判断。若为生理性因素引起，可能随时间推移逐渐消退；若为病理性因素导致，则通常无法自愈。
阴茎部位的小肉粒可能由不同原因导致。珍珠疹是常见的生理性现象，表现为冠状沟周围排列规则的白色小丘疹，可能与局部卫生状况或生理发育相关，通常无自觉症状且可能自行消退。若为尖锐湿疣等病理性改变，由人乳头瘤病毒感染引起，其表面多呈菜花状或乳头状，具有传染性且不会自行消退，需通过冷冻、激光或药物（如咪喹莫特乳膏、鬼臼毒素酊）干预治疗。
日常需保持生殖器清洁干燥，避免过度摩擦或自行搔抓。若小肉粒持续存在、体积增大或伴随出血、渗液等症状，建议及时到皮肤科就诊，由医生通过醋酸白试验或病理检查明确诊断后规范处理。