褪黑素与其他药物是否冲突通常需要根据具体药物类型来判断，不能一概而论。使用褪黑素前建议咨询医生或药师，以避免潜在的药物相互作用。
褪黑素可能影响某些药物的代谢效果。例如与抗凝血药如华法林钠、阿司匹林联用时，可能增强抗凝作用，增加出血风险；与降压药如硝苯地平、氨氯地平等联用，可能过度降低血压；与免疫抑制剂如环孢素、他克莫司联用，可能干扰药物浓度。此外，避孕药或含雌激素的药物可能影响褪黑素的代谢，导致其体内浓度升高。部分抗抑郁药如氟西汀、舍曲林也可能与褪黑素产生协同作用，增加嗜睡等副作用。
日常使用褪黑素时，应避免饮酒或饮用含咖啡因的饮品，以免加重中枢神经系统抑制。若正在服用慢性病药物或精神类药物，需主动告知医生正在补充褪黑素的情况。药物联用期间出现异常疲倦、头晕、出血等情况时，应及时停药并就医。