头孢克肟对慢性咽炎的治疗效果需根据具体病因判断。若为细菌感染引起，可能有一定疗效；但多数情况下慢性咽炎并非单纯细菌感染所致，盲目使用抗生素可能无效。
慢性咽炎的病因复杂，细菌感染仅占少数情况。若通过咽拭子培养明确存在链球菌等敏感菌感染，头孢克肟作为第三代头孢菌素可通过抑制细菌细胞壁合成发挥抗菌作用。但对于病毒性感染、过敏性咽炎或胃食管反流导致的咽部慢性炎症，该药物并无直接治疗作用。
临床治疗慢性咽炎需针对病因采取综合措施。反流性咽炎需配合抑酸药物如奥美拉唑，过敏性咽炎需使用抗组胺药物如氯雷他定，同时应避免接触烟雾、粉尘等刺激因素。若需使用抗生素，应严格遵循细菌学检查结果和医生指导，避免滥用导致耐药性发生。