肛周脓肿可通过症状表现、体征差异以及相关检查与其他肛肠疾病进行鉴别，常见需鉴别的疾病包括肛瘘、痔疮、肛裂及肛周湿疹等。以下是具体鉴别要点：
1、肛瘘
肛瘘多为肛周脓肿迁延不愈发展而来，主要表现为肛周反复流脓、瘙痒，触诊可触及条索状瘘管，瘘管存在内口和外口。而肛周脓肿以局部红肿热痛为主，脓肿为单发硬结，破溃前无瘘管形成，直肠指诊可触及波动感肿块。
2、痔疮
痔疮典型症状为无痛性便血和肛门肿物脱出，内痔便血多为鲜红色且与粪便分离，外痔可见肛周皮赘。肛周脓肿则伴随剧烈疼痛和皮肤红肿，触痛明显，按压时无便血表现，且肿块位置较深。
3、肛裂
肛裂特征为排便时撕裂样疼痛和便后持续疼痛，伴有少量便血，检查可见肛门后正中线处纵向裂口。肛周脓肿疼痛呈持续性跳痛，与排便无直接关联，病灶多位于肛门两侧，可见局限性隆起而非线性裂伤。
4、肛周湿疹
该病以剧烈瘙痒为主，皮肤出现丘疹、糜烂等湿疹样改变，无局部红肿热痛等感染体征。肛周脓肿则表现为明确的感染性病灶，可见皮肤温度升高和压痛性包块，严重者伴有发热等全身症状。
若出现肛周肿痛、分泌物增多等症状，建议及时到肛肠科就诊。通过直肠指诊、肛周超声或MRI等检查可明确诊断，避免将肛周脓肿误诊为其他肛肠疾病而延误抗感染或手术治疗时机。