肛瘘通常无法自行愈合，建议及时就医处理。该疾病多由肛周脓肿溃破或切开引流后形成，瘘管的存在可能导致反复感染或病情加重，因此一般不会自愈。
肛瘘的瘘管由内口、瘘管和外口组成，感染源常位于肛腺或直肠黏膜。由于肛门部位的特殊环境，粪便和细菌容易进入瘘管，导致持续感染。即使外口暂时闭合，内口处的感染仍会反复发作，形成新的脓肿或复杂性肛瘘。此外，长期炎症刺激可能使瘘管壁纤维化，进一步阻碍组织自然修复。
若长期不治疗，可能引发肛门周围皮肤湿疹、脓肿反复破溃，甚至导致肛门括约肌损伤，影响控便功能。对于确诊的肛瘘，临床常采用瘘管切开术、挂线疗法或激光手术等治疗方式，以彻底清除病灶。术后需遵医嘱定期换药，并保持肛周清洁干燥。
建议患者避免自行挤压或使用偏方处理，以免加重感染。日常注意饮食清淡，保持规律排便，出现肛周肿痛、渗液等症状时，应及时至肛肠专科就诊。通过规范治疗，大多数肛瘘患者可获得良好预后。