肛瘘通常需要通过手术才能达到治愈效果，但具体治疗方式需根据病情严重程度和患者个体情况而定。部分患者可能因身体状况或其他原因暂时无法手术，此时可考虑保守治疗缓解症状。
肛瘘是肛周感染形成的异常通道，单纯使用药物或保守治疗一般无法彻底清除瘘管组织，容易反复发作。对于低位单纯性肛瘘，手术如肛瘘切开术、挂线疗法等能直接去除病灶，治愈率较高。复杂或高位肛瘘可能需要分阶段手术，结合影像学检查明确瘘管走向。术后配合坐浴、抗生素如头孢克肟、阿莫西林等预防感染，多数患者可获得良好预后。
非手术治疗主要适用于急性感染期控制炎症，常用高锰酸钾坐浴缓解局部症状，配合甲硝唑、左氧氟沙星等抗生素治疗。但保守治疗无法消除已形成的瘘管，存在复发风险。若发现肛周反复流脓、肿痛等症状，应及时到肛肠专科就诊，通过直肠指检、肛周超声等明确诊断，在医生指导下选择适宜治疗方案。术后需保持肛周清洁，避免久坐久站，促进伤口愈合。