干细胞临床应用的潜在风险主要包括免疫排斥反应、感染风险、肿瘤形成风险等，需在严格监管下开展相关治疗。
1、免疫排斥反应
异体来源的干细胞可能被患者免疫系统识别为外来物质，引发发热、皮疹等免疫排斥反应。这种情况在未进行充分配型或使用免疫抑制剂的情况下更易发生，严重时可能影响器官功能。
2、感染风险
干细胞提取、培养或回输过程中若操作不规范，可能发生细菌或病毒污染。尤其是采用侵入性注射方式时，存在局部红肿、化脓等感染风险，免疫功能低下者还可能引发全身性感染。
3、肿瘤形成风险
部分具有多向分化潜能的干细胞可能在体内异常增殖，形成畸胎瘤等肿瘤组织。日本曾报道过视网膜干细胞治疗后出现脑瘤的案例，这与干细胞分化调控机制不完善密切相关。
开展干细胞治疗应选择国家批准的正规医疗机构，详细了解治疗方案风险受益比。治疗前需签署知情同意书，治疗后密切监测异常反应。