干细胞疗法目前主要适用于某些血液系统肿瘤患者，如急性白血病、淋巴瘤、多发性骨髓瘤等，在实体瘤中的应用仍处于临床试验阶段。其适用性需根据患者病情及分型综合评估，建议在血液科或肿瘤科专家指导下进行个体化选择。
对于血液系统肿瘤，干细胞疗法常用于化疗或放疗后的造血功能重建。急性白血病患者接受大剂量化疗后，自体或异体造血干细胞移植可帮助恢复骨髓造血能力。异基因移植还能通过移植物抗肿瘤效应降低复发风险，但存在移植物抗宿主病等并发症可能。
淋巴瘤患者进行干细胞移植的适应症包括复发难治性病例或高危型患者。自体移植可延长无进展生存期，异体移植适用于特定基因突变类型。多发性骨髓瘤患者通过自体干细胞移植联合新药治疗，可显著提高完全缓解率，延长生存时间。
实体瘤中干细胞疗法尚处于探索阶段，部分临床试验尝试用于晚期乳腺癌、神经母细胞瘤等。基因修饰的干细胞载体可定向输送抗癌药物，间充质干细胞具有调节肿瘤微环境作用，但疗效和安全性仍需更多循证医学证据支持。任何治疗决策都需经多学科团队讨论，结合患者体能状态、肿瘤生物学特性综合判断。