肝囊肿一般不会遗传，但多囊肝病可能与遗传因素有关。普通肝囊肿多为先天性但非遗传性疾病，而多囊肝病属于常染色体显性遗传病，有家族史者需重点预防。
普通肝囊肿通常是胚胎期胆管发育异常形成的孤立性囊肿，与遗传无关。此类囊肿生长缓慢且多数无症状，无需特殊处理，定期超声监测即可。多囊肝病则与基因突变相关，患者常有家族史，可能伴随多囊肾等病变。若父母一方患病，子女有50%概率遗传突变基因，需通过基因检测明确风险。
有肝囊肿家族史的人群应定期进行腹部超声或CT检查，建议每年至少一次。保持健康生活方式，避免饮酒及高脂饮食，减少肝脏负担。若确诊多囊肝病，需密切监测肝功能及囊肿大小，必要时在医生指导下进行介入治疗或手术。日常避免腹部外伤，防止囊肿破裂。
存在肝囊肿家族史者建议就诊消化内科或遗传咨询科，通过专业评估制定个体化随访方案。孕期女性应加强产前筛查，早期发现胎儿异常。