氟康唑与益生菌之间可能存在相互作用，但通常不涉及直接抑制或灭活。氟康唑是一种抗真菌药物，主要用于治疗念珠菌等真菌感染，而益生菌是含有活性微生物的制剂，常用于调节肠道菌群平衡。
氟康唑可能通过抑制真菌生长间接影响肠道菌群环境。长期或大剂量使用氟康唑可能导致肠道菌群失调症，此时补充益生菌有助于恢复菌群平衡。但氟康唑对益生菌中的细菌成分（如乳酸杆菌、双歧杆菌）无直接杀灭作用，两者在作用机制上无冲突。需要注意的是，益生菌与氟康唑同时服用可能因药物吸收时间差异影响疗效，建议间隔2小时以上使用。
若需同时使用氟康唑与益生菌，应在医生指导下调整用药顺序和间隔时间。避免自行联用导致药物相互作用风险，用药期间出现腹泻、腹胀等异常症状应及时就医。