恩替卡韦与替诺福韦均为治疗慢性乙型肝炎的一线抗病毒药物，两者的抗病毒效果相近，但具体疗效需结合患者个体情况判断。选择时需考虑耐药性、副作用及患者基础疾病等因素。
从抗病毒能力来看，恩替卡韦和替诺福韦均能强效抑制乙肝病毒DNA复制，临床研究显示两者治疗48周时的病毒学应答率均超过90%。对于初治患者，两者均可作为首选。耐药性方面，恩替卡韦5年耐药率约1.2%，而替诺福韦尚未发现确认的耐药病例，更适合有拉米夫定耐药史的患者。在特殊人群应用中，替诺福韦艾拉酚胺（TAF）因骨肾安全性更优，适用于存在骨质疏松或肾功能异常者，而恩替卡韦对妊娠期妇女的安全性证据更充分。
建议患者在感染科或肝病科医生指导下选择药物，治疗期间需每3-6个月监测肝功能、病毒载量及肾功能等指标。用药期间避免擅自停药，若出现肌酐升高或骨痛等不适应及时就诊调整方案。