低温处理的大豆在制作豆浆的过程中可能保留更多活性成分，但具体效果需根据加工方式和成分性质进行判断。传统高温熬煮可能导致部分热敏性营养物质流失，而冷泡或低温研磨等方式有助于减少这类损失。
大豆中含有异黄酮、皂苷、维生素B族等活性成分，其中部分物质对高温敏感。低温研磨或冷泡后直接过滤的方式，理论上能保留更多大豆异黄酮等热敏物质。研究发现，60℃以下的加工环境可保留约85%的大豆异黄酮，而煮沸处理可能导致其损失15%-20%。但这种方法无法有效消除大豆中的胰蛋白酶抑制剂等抗营养因子。
高温熬煮虽会破坏部分维生素，但能显著降低抗营养因子含量。实验数据显示，煮沸15分钟可消除90%以上的胰蛋白酶抑制剂，同时使蛋白质消化率提高40%。对于脂氧合酶等可能引起豆腥味的酶类，80℃以上热处理才能有效灭活。
建议根据具体需求选择加工方式。若需获取活性成分，可采用低温研磨后适度加热的折中方式，既能保留部分热敏物质，又能确保食品安全。消化功能较弱者或儿童饮用时，仍建议充分加热以消除抗营养因子。若饮用后出现腹胀等不适，应及时就医排查食物不耐受等情况。