大豆异黄酮与乳腺癌风险的关系不能一概而论，需结合摄入量、个体健康状况等因素综合判断。适量摄入大豆异黄酮可能对部分人群具有保护作用，但过量摄入或特定情况下可能产生负面影响。
适量摄入大豆异黄酮可能通过其植物雌激素特性发挥双向调节作用。流行病学调查显示，亚洲国家女性乳腺癌发病率较低与长期适量食用大豆制品存在相关性，其中大豆异黄酮可能通过竞争性结合雌激素受体，降低高活性雌激素对乳腺组织的刺激。临床研究也发现，每日摄入25-50毫克大豆异黄酮可能降低绝经前女性乳腺癌风险约30%。
但特定情况下需谨慎摄入。雌激素受体阳性乳腺癌患者应控制大豆制品摄入量，体外实验显示高浓度大豆异黄酮（超过100毫克/天）可能促进癌细胞增殖。基因检测发现携带特定CYP1A1基因多态性人群，大豆异黄酮代谢产物可能产生促癌效应。术后接受内分泌治疗的患者，大豆异黄酮可能与他莫昔芬等药物产生相互作用。
日常膳食中建议通过天然豆制品获取大豆异黄酮，如每日食用50克豆腐或200毫升豆浆即可满足需求。乳腺癌高危人群或确诊患者应在营养师指导下制定个体化膳食方案，避免盲目服用提纯的大豆异黄酮补充剂。目前国内外指南均建议平衡膳食为主，不推荐单纯通过补充大豆异黄酮预防乳腺癌。