高温灭菌奶在加工时通常会损失维生素B1、维生素C、乳铁蛋白等成分。
1、维生素B1
维生素B1属于水溶性维生素，对能量代谢和神经系统功能有重要作用。高温灭菌时，牛奶中的维生素B1容易受热分解，其含量可能下降约30%。长期饮用高温灭菌奶需注意膳食中其他维生素B1的补充。
2、维生素C
牛奶本身维生素C含量较低，每100毫升约含1毫克。高温灭菌过程中，维生素C受热易氧化分解，灭菌后含量可能减少50%以上。但牛奶并非人体维生素C的主要来源，实际影响较小。
3、乳铁蛋白
这种天然活性蛋白具有抗菌和调节免疫的作用。当灭菌温度超过90℃时，乳铁蛋白的空间结构会发生不可逆变性，生物活性基本丧失。巴氏杀菌法可保留更多乳铁蛋白活性。
日常饮用灭菌牛奶时，建议搭配新鲜果蔬补充维生素。对于需要活性营养成分的人群，可选择低温巴氏杀菌奶或未经过高温处理的鲜牛奶，开封后需冷藏并在保质期内尽快饮用。特殊营养需求者建议在营养师指导下选择乳制品。