肠易激综合征的发病通常与肠道菌群失调存在关联。肠道菌群紊乱可能通过影响肠道敏感性、免疫功能及代谢产物等因素参与疾病的发生发展，但具体机制仍需进一步研究。
肠道菌群失调可能导致肠道黏膜通透性增加，使有害物质更易穿过肠屏障，激活肠道免疫系统引发炎症反应。同时，菌群代谢产物如短链脂肪酸的异常可能干扰肠道神经信号传导，加剧腹痛、腹胀等症状。部分患者使用益生菌调节菌群后，腹泻、便秘等消化道症状可得到缓解，也间接证实两者存在相关性。
虽然肠道菌群紊乱是重要诱因，但肠易激综合征的发病还涉及内脏高敏感性、脑-肠轴调节异常、精神心理因素等多重机制。若出现持续腹痛、排便习惯改变等症状，建议及时消化内科就诊，通过粪便菌群检测等检查明确肠道微生态状况，在医生指导下进行个体化综合治疗。