贲门肿瘤良恶性的区分通常需要结合影像学检查、内镜特征和病理活检结果综合分析。活检作为诊断的金标准，准确性较高，但仍可能受取样位置、肿瘤大小等因素影响，需结合临床综合判断。
贲门肿瘤的良恶性主要通过组织形态学特征进行鉴别。良性肿瘤细胞形态规则、生长缓慢且无浸润性；恶性肿瘤细胞异型性明显，核分裂活跃，常伴随周围组织侵犯或淋巴结转移。影像学检查如CT可观察肿瘤边界及浸润范围，内镜下可见恶性病变表面糜烂、质地脆硬等特征。
病理活检的准确性与操作技术密切相关。常规内镜活检的准确率可达70%-90%，但若肿瘤位置深在或表面坏死，可能出现假阴性。超声内镜引导下穿刺可提高深层组织的取样准确性。对于难以确诊的病例，可能需要多次活检或结合免疫组化、基因检测进一步分析。
建议发现贲门占位时及时进行规范的内镜检查及活检。若初次结果不明确，可在医生指导下选择超声内镜、增强CT等补充检查。治疗方案需根据最终病理结果制定，避免仅凭单一检查结论过早干预。