艾滋病晚期患者由于免疫系统严重受损，可能并发严重的机会性感染、恶性肿瘤、消耗综合征及神经系统病变等，需积极进行抗病毒及对症治疗。
1、机会性感染
艾滋病晚期患者CD4+T淋巴细胞数量显著降低，易发生多种病原体感染。如肺孢子菌肺炎常引起干咳、发热、呼吸困难；结核病可导致咳嗽、咯血、消瘦；巨细胞病毒感染可能诱发视网膜炎、结肠炎等。治疗时需根据病原体选择药物，例如使用复方磺胺甲噁唑治疗肺孢子菌肺炎，采用异烟肼、利福平、乙胺丁醇联合方案治疗结核病，更昔洛韦可用于巨细胞病毒感染。
2、恶性肿瘤
免疫缺陷导致机体丧失肿瘤监控能力，易发生卡波西肉瘤、非霍奇金淋巴瘤等肿瘤。卡波西肉瘤表现为皮肤紫红色斑块或内脏受累，可联合化疗与抗病毒治疗；淋巴瘤多伴随淋巴结肿大、发热等症状，需采用CHOP方案等化疗手段。此类肿瘤进展迅速，需早期发现干预。
3、消耗综合征
患者常出现持续1个月以上的体重下降超过10%，伴随慢性腹泻、乏力等症状。这与HIV直接损伤肠道、营养吸收障碍及代谢紊乱有关。治疗需加强营养支持，给予高蛋白饮食，必要时通过肠内或肠外营养补充，同时维持电解质平衡。
4、神经系统病变
HIV可突破血脑屏障直接侵袭中枢神经，引发艾滋病痴呆综合征，表现为认知功能下降、运动失调。弓形虫脑病则会出现头痛、癫痫、意识障碍，需通过磁共振检查确诊，使用乙胺嘧啶联合磺胺嘧啶治疗。巨细胞病毒脑炎可导致精神异常、视力障碍。
晚期艾滋病患者应及时进行高效抗逆转录病毒治疗（HAART），定期监测CD4+细胞计数和病毒载量。出现并发症后需在感染科医生指导下制定个体化治疗方案，同时注意预防继发感染，保持环境清洁，避免生食，定期进行机会性感染筛查。