埃博拉病毒与马尔堡病毒的区别主要包括病毒类型、致死率、地理分布及疫苗研发进展等方面。两者虽同属丝状病毒科，但属于不同属，致病特点存在差异。
埃博拉病毒分为扎伊尔型、苏丹型等5个亚型，其中扎伊尔型致死率最高，可达90%。患者早期表现为发热、肌肉疼痛，随后出现呕吐、腹泻及多器官出血。马尔堡病毒致死率约为24%-88%，症状与埃博拉相似，但部分病例出血症状较轻，可能出现斑丘疹等皮肤表现。基因序列分析显示，两者核蛋白结构差异超过40%，这是分类学区分的重要依据。
在地理分布方面，埃博拉疫情主要集中在中非和西非，1976年首次暴发于刚果埃博拉河流域。马尔堡病毒最早发现于德国马尔堡，自然宿主为非洲果蝠，疫情多发生于东非和南非地区。预防措施中，埃博拉病毒已有Ervebo疫苗获批使用，而马尔堡病毒疫苗尚处于临床试验阶段，当前主要采用支持疗法控制症状。
接触野生动物体液是两者共同传播途径，建议在疫区避免进入洞穴、接触病患或死亡动物。出现疑似症状应立即隔离并报告卫生部门，医护人员需严格执行三级防护。病毒学研究显示，这两种病原体存在基因重组风险，持续监测其变异对全球公共卫生安全至关重要。