HPV疫苗不能治疗已经存在的HPV感染。该疫苗的主要作用是预防特定型别HPV的感染，从而降低相关疾病的发生风险，但其无法清除体内已感染的病毒。
HPV疫苗通过刺激机体产生针对特定HPV型别的抗体，从而在暴露于病毒时提供保护。但疫苗不含抗病毒成分，对于已经感染的HPV病毒没有清除或治疗作用。如果已经发生感染，疫苗也无法改变感染进程或阻止相关病变的发展。目前针对HPV感染本身并无特效药物，主要依靠机体免疫力自然清除病毒。若感染持续存在并引发宫颈病变等后果，需通过宫颈锥切术等医疗手段进行治疗。
建议适龄女性在未感染HPV前尽早接种疫苗以获得最佳保护效果。即使已经接种疫苗，仍需要定期进行宫颈癌筛查，以便早期发现和处理HPV感染导致的病变。对于已经感染的患者，应遵医嘱进行随访观察或进一步治疗。