HPV疫苗不能预防所有宫颈癌，其保护范围与疫苗覆盖的病毒亚型有关。目前市面上的HPV疫苗主要针对高危型HPV中的特定种类，例如二价疫苗可预防HPV16、18型，四价和九价疫苗在此基础上增加了对其他高危亚型的防护。但仍有部分高危型HPV未被覆盖，且宫颈癌的发生还可能与其他非HPV因素相关。
HPV疫苗主要通过预防高危型HPV的持续感染来降低宫颈癌风险。HPV16和18型是导致约70%宫颈癌的主要亚型，九价疫苗在此基础上还可预防HPV31、33、45、52、58型，将防护范围提升至约90%的宫颈癌病例。但仍有约10%的宫颈癌由其他高危型HPV或非HPV因素引起，如长期炎症、免疫系统异常等。
接种HPV疫苗后仍需定期进行宫颈癌筛查，包括HPV检测和宫颈细胞学检查。筛查能及时发现疫苗未覆盖的HPV感染或癌前病变，建议21岁以上女性每3年进行筛查，30岁以上可联合HPV检测延长至5年。若发现异常阴道出血、排液等症状，应及时就诊妇科进行阴道镜等检查。