生殖器疱疹病毒一般不会直接影响男性的生育能力，但在某些情况下可能造成间接影响。该疾病主要引起生殖器部位的水疱、溃疡及疼痛等症状，但精子的生成和运输功能通常不会受到病毒损害。
生殖器疱疹由单纯疱疹病毒引起，感染后病毒主要潜伏在神经节中，复发时沿神经迁移至皮肤黏膜引发皮损。大多数情况下，病毒不会侵入睾丸或附睾等生精器官，因此不会导致精子数量减少或质量下降。但若合并细菌感染引发尿道狭窄，可能影响精液排出。极少数情况下，生殖器溃疡愈合后形成的瘢痕可能阻塞输精管，这种情况较为罕见。
若出现反复发作的生殖器疱疹，建议避免在发作期进行性生活，正确使用安全套降低传染风险。保持患处清洁干燥有助于促进溃疡愈合，必要时可在医生指导下使用阿昔洛韦等抗病毒药物控制病情。对于存在尿道狭窄或输精管梗阻的患者，需通过手术解除梗阻。备孕前建议进行生殖健康评估，并与医生充分沟通感染控制方案。