山萸肉作为中药材，可能对调节内分泌系统有一定辅助作用，但具体效果因人而异。现代医学尚未明确证实其具有直接调节内分泌系统的功效，建议在医生指导下合理使用。
从中医理论来看，山萸肉具有补益肝肾的功效，而肝肾与内分泌功能存在关联性。部分研究表明其含有的活性成分可能通过影响激素代谢途径产生调节作用，但相关研究多局限于动物实验阶段。在临床实践中，有医者将其配伍应用于月经不调、更年期综合征等与内分泌相关的病症调理。
需要注意个体体质差异可能导致不同反应。对于确诊的内分泌疾病如甲状腺功能异常、多囊卵巢综合征等，仍需以规范的西医治疗为主。若需使用山萸肉进行调理，建议到正规中医院就诊，由中医师根据体质辨证开具合理方剂，避免自行长期大量服用，以免干扰正常内分泌功能。