茜草长期使用可能会产生副作用，但具体是否发生与个人体质、用药剂量等因素有关。一般情况下，遵医嘱短期使用较为安全，但若长期或过量服用，需警惕潜在的不良反应。
茜草中含有蒽醌类化合物等成分，长期摄入可能刺激胃肠道黏膜，引发腹痛、腹泻、恶心等消化道不适症状。部分人群可能因代谢能力差异，导致药物成分在体内蓄积，增加肝肾负担，严重时可能诱发肝肾功能异常。少数过敏体质者接触茜草后可能出现皮肤瘙痒、红疹等过敏反应，需立即停用并就医。
使用茜草前应明确自身健康状况，慢性肝病、肾病患者以及孕妇等特殊人群需谨慎使用。建议在中医师指导下规范用药，避免自行长期服用。用药期间如出现食欲减退、尿色异常或乏力等症状，应及时停药并就诊检查肝肾功能。