硼砂在妇科疾病治疗中的应用需谨慎，其作为传统外用药物，通常需在医生指导下使用。目前其应用范围有限，可能涉及部分感染性疾病的辅助处理，但现代临床更推荐使用安全性更高的替代药物。
硼砂化学成分为四硼酸钠，具有弱碱性环境改变作用，可能通过破坏微生物细胞膜结构产生抑菌效果。在既往医疗实践中，曾有稀释后用于外阴部清洁的案例，浓度需控制在0.5%-1%之间，使用前需经高温灭菌处理。对于念珠菌性外阴炎，曾有文献记载配合其他中药进行坐浴的疗法，但缺乏大规模临床研究支持。
需要注意硼砂属于低毒类物质，经黏膜吸收后可能引起代谢性酸中毒等不良反应。2015年版《中国药典》已删除硼砂作为内服药物的收录，仅保留外用剂型。现代妇科临床更倾向使用聚维酮碘溶液、克霉唑栓等经循证医学验证的药物。任何妇科治疗方案都应在专业医师指导下进行，不建议自行使用硼砂制剂。