生殖器疱疹的痊愈时间因人而异，通常无法一概而论。初次发作的病程一般为2-3周，复发病例症状较轻且持续时间较短，具体恢复时间与治疗时机、免疫状态等因素相关。
治疗及时性直接影响病程进展。若在出现水疱、疼痛等初期症状时立即使用阿昔洛韦片、泛昔洛韦胶囊或伐昔洛韦片等抗病毒药物，通常可将病程缩短至5-7天。免疫系统功能较强的患者，病毒清除速度相对较快，复发频率也较低。但需注意，疱疹病毒会长期潜伏在神经节中，在免疫力下降时可能复发。
建议患者出现生殖器疱疹症状后及时到皮肤性病科就诊，在医生指导下规范使用抗病毒药物。治疗期间需保持患处清洁干燥，避免性接触及共用个人物品。日常应加强锻炼、均衡营养以提高免疫力，减少复发风险。