宫颈囊肿通常不会直接导致月经紊乱。宫颈囊肿一般是宫颈腺体分泌物潴留形成的囊性病变，属于常见的宫颈良性改变，多与慢性宫颈炎有关，而月经周期主要受下丘脑-垂体-卵巢轴调控。
月经紊乱的发生常与内分泌失调、卵巢功能异常、子宫病变等因素相关。例如多囊卵巢综合征会导致雄激素升高和排卵障碍，引发月经稀发或闭经；甲状腺功能亢进或减退会影响性激素结合球蛋白水平，干扰月经周期；子宫肌瘤特别是黏膜下肌瘤可能通过改变宫腔形态或引发异常出血。
若宫颈囊肿合并感染，可能因炎症反应间接影响生殖系统功能，但这种情况较为少见。当出现月经周期缩短、经期延长、经量异常等症状时，建议进行性激素六项检测、盆腔超声等检查，排除排卵障碍、子宫内膜息肉等常见病因。日常应注意观察月经变化，记录基础体温，及时就诊妇科查明原因。