益生菌不适合严重免疫缺陷者、危重症患者以及过敏体质者等人群食用。食用前需根据自身情况评估风险，必要时咨询医生建议。
1、严重免疫缺陷者
严重免疫缺陷患者如白血病、艾滋病晚期等，免疫系统功能极度低下。益生菌作为活性微生物可能突破肠道屏障进入血液，引发菌血症或败血症等严重感染。此类患者肠道屏障功能受损，无法有效阻隔微生物入侵，使用益生菌存在较高风险。
2、危重症患者
处于重症监护状态的患者如多器官衰竭、严重创伤或大手术后，机体处于高度应激状态。此时肠道通透性增加，益生菌可能通过受损的肠黏膜移位至其他器官。临床研究表明，这类患者使用益生菌可能增加感染性并发症发生率，影响疾病恢复进程。
3、过敏体质者
部分益生菌制剂含有乳制品、大豆蛋白等辅料成分，可能引发过敏反应。对特定菌株如乳酸杆菌、双歧杆菌过敏者，摄入后可能出现皮疹、腹泻、呼吸道症状等过敏表现。选择益生菌产品时需仔细查看成分表，必要时进行过敏原检测。
存在上述情况的人群应谨慎使用益生菌制剂，尤其避免自行购买服用。确有需要使用时应由专业医师评估，选择合适菌株及剂型，并在医疗监护下进行。健康人群食用益生菌也需注意控制剂量，避免长期过量摄入导致肠道菌群失衡。