肛瘘一般不能自愈，通常需要积极治疗才能恢复。肛瘘是肛周脓肿破溃或切开后形成的慢性感染性管道，由于瘘管的存在，感染可能反复发作。
肛瘘的瘘管由内口、外口和窦道组成，内口多位于肛门内的肛窦处，容易受到粪便污染而持续感染。瘘管壁可能形成纤维化组织，导致管道无法自行闭合。即使外口暂时愈合，内口仍存在感染源，可能再次形成脓肿或破溃。若长期不治疗，可能引发复杂性肛瘘或肛门功能受损。
对于肛瘘患者，建议及时到肛肠外科就诊，医生会根据瘘管的位置和复杂程度选择手术方式，如肛瘘切开术、挂线疗法等。术后需注意伤口清洁，避免感染，促进愈合。日常保持清淡饮食、规律排便习惯也有助于减少复发风险。